A lo largo de sus más de treinta años de creada esta Fundación ha conformado varias colecciones editoriales:
Colección Clásica, que hace posible que los autores y textos fundamentales, comprendidos en un lapso que abarca desde la época prehispánica hasta el presente, estén al alcance de las nuevas generaciones de lectores y especialistas en las diferentes temáticas latinoamericanas y caribeñas.
Colección Claves de América, dedicada a editar versiones abreviadas o antológicas de los autores publicados en la Colección Clásica, siguiendo también el rastro del dinámico género de la crónica que narra las maravillas del mundo americano.
Colección La Expresión Americana, destinada a ampliar la temática y los intereses de las obras publicadas por Biblioteca Ayacucho mediante la edición de libros de relieve memorialista, biográfico, autobiográfico y otros materiales de índole personal al igual que trabajos de naturaleza ensayística, tratando de encontrar en los diversos registros de la prosa una sostenida discusión y meditación estética a lo largo de la historia de la cultura escrita en nuestro continente.
Colección Documentos, destinada a conformar volúmenes que sean productos de investigaciones de equipos interdisciplinarios y ofrezcan textos de apoyo referencial a los lectores. También recoge materiales iconográficos relativos a los grandes autores publicados en la Colección Clásica.
Colección Paralelos, que agrupa textos que por su temática complementan los alcances de la Colección Clásica y multiplican las líneas de acercamiento a la cultura latinoamericana.
Colección Claves Políticas de América, creada con el propósito de recoger lo más significativo de la historia de los movimientos y procesos políticos ocurridos en nuestro continente. Aborda su materia a partir del pensamiento de los momentos y líderes históricos, de los nombres en torno a los cuales se forjaron procesos importantes en sus países de origen que deben ser entendidos dentro de la historia social latinoamericana y caribeña.
Colección Futuro, destinada a la actualidad innovadora de nuestras letras. Incluye, preferentemente, antologías regionales de autores ya reconocidos y valorados por la crítica alerta, pero que requieren mayor atención y difusión. Escritos que configuran el hacer literario actual y se proyectan con fuerza creativa en el horizonte de lo nuevo, donde se gestan las tendencias de la escritura continental.
